메타유전체 분석서비스


Matagenome Sequencing Service

Matagenome sequencing은 환경샘플(검체)에서 전체 DNA를 추출하고, NGS(차세대 유전자분석기법, Next Generation Sequencing)플랫폼을 통하여 미생물(Microbial)의 염기서열을 읽어들여 미생물의 군집구조(Microbial community) 및 메타유전체(Metagenome)을 분석할 수 있습니다. 미생물을 직접 배양하지 않고 채취한 검체의 DNA를 통해 세균들의 유전정보를 획득하여 조성을 확인할 수 있습니다. 단일 생물종을 넘어서서 특정 환경에서 수집한 샘플에 함유된 유전체를 분석함으로써 각 환경의 미생물 군집을 패턴 차이 및 상호작용에 대해 확인하는 방법입니다. 종 식별 마커로 사용되는 16S rRNA나 18S rRNA 등을 통해 최근 주목받고 있는 장내 미생물의 분포 및 관련된 임상 연구, 생명공학 등에 널리 사용될 수 있습니다.

  • Service Workflow
    • DNA QC
    • Library prep
    • NGS
    • Data Analysis
    • Report
  • NGS Platform
    • Library method : 16s rDNA Amplicon Library for illumina (V3 to V4 Regions)
    • NGS run format : Illumina MiSeq (Paired End 300bp)
  • Sample Requirements
    유전체 분석서비스에 대한 테이블로 DNA와 RNA의 Amount,Volume,Quantity,Concentration,Purity,Condition으로 구성되어 있습니다.

    		DNARNA
    Amount≥200 ng≥200 ng
    Volume≥ 20 μl≥ 20 μl
    Quantity≥ 1㎍≥ 1㎍
    Concentration10 ng/μl ~ 50 ng/㎕10 ng/μl ~ 65 ng/㎕
    PurityOD 260/280 = 1.6 ~ 2.2RIN ≥ 7.0
    ConditionWithout degradation
    /RNA contamination    		Without degradation
    /DNA contamination
  • Data analysis
    • Assembly Result, Feature Table, Taxonomy, Diversity, Sample Clustering 등 분석 지원
  • 서비스 문의 및 상담
    • 이메일 : yo217@srcm.kr
    • 전화번호 : 063-650-2032